Lahir di Llerena, Badajoz, Cortés memulai debut profesionalnya bersama CF Extremadura di Segunda División. Ia kemudian pindah ke RCD Mallorca di La Liga (bersama rekan setimnya Poli), di mana ia menjadi pilihan utama selama tiga musim penuh, membantu tim Kepulauan Balearic meraih edisi Copa del Rey tahun 2003.
Pada musim panas 2006, Cortés bergabung dengan Getafe CF di Madrid. Setelah berbagi peran dengan pemain Romania Cosmin Contra pada musim 2006-2007, ia memulai musim berikutnya ketika tim mencapai perempat final UEFA Cup.
Pada musim 2009-2010, dengan Contra sudah pergi, Cortés terlupakan oleh kehadiran pemain baru Miguel Torres, tetapi tetap memberikan kontribusi dalam 20 pertandingan liga saat Getafe berhasil lolos ke Liga Europa untuk kedua kalinya dalam sejarah klub. Pada Juli 2010, ketika hampir berusia 31 tahun, ia menandatangani kontrak satu tahun dengan Hércules CF, yang kembali ke kasta tertinggi setelah 13 tahun absen.
Cortés menjadi bek kanan pilihan utama selama satu musim bersama Hércules, yang finis di peringkat 19 dan langsung terdegradasi. Pada pertengahan Juli 2011, ia bergabung dengan Granada CF juga dari divisi teratas dengan kontrak dua tahun.
Dari tahun 2012 hingga 2014, Cortés berkompetisi di divisi kedua dengan Hércules dan Real Zaragoza. Pada 15 September 2014, pada usia 35 tahun, ia pindah ke luar negeri untuk pertama kalinya, bergabung dengan klub Denmark Aarhus Gymnastikforening di Divisi 1 selama satu tahun sebelum pensiun setelah membantu mereka meraih promosi.
Follow