Pada tanggal 8 Juni 2011, Pérez bergabung dengan klub Portugal, Benfica, dengan kontrak berdurasi lima tahun. Di Benfica, ia meraih lima gelar, termasuk treble domestik pada musim 2013-2014 dan mencapai dua final berturut-turut di Liga Europa UEFA. Pada musim 2014-2015, Pérez berhasil meraih Supertaça Cândido de Oliveira, sehingga ia memenangkan semua empat gelar Portugal dengan Benfica dalam satu tahun kalender.
Pada tanggal 2 Januari 2015, Pérez pindah ke klub La Liga, Valencia CF, dengan biaya transfer sebesar €25 juta. Ia melakukan debutnya untuk Valencia dalam kemenangan kandang melawan Real Madrid (2-1) di La Liga. Setelah itu, pada tanggal 29 Juni 2017, Pérez kembali ke Argentina dan bergabung dengan River Plate. Pada tanggal 19 Mei 2021, dalam pertandingan Copa Libertadores, Pérez bermain sebagai penjaga gawang karena absennya semua penjaga gawang di timnya akibat wabah COVID-19. Ia tampil luar biasa dan berhasil membawa River Plate meraih kemenangan 2-1, sehingga ia dinobatkan sebagai pemain terbaik dalam pertandingan tersebut.
Pada bulan Januari 2024, Pérez kembali lagi ke Estudiantes untuk kali ketiga dengan menandatangani kontrak selama satu tahun. Di level internasional, Pérez melakukan debutnya untuk tim nasional Argentina pada tanggal 30 September 2009 dalam pertandingan persahabatan melawan Ghana yang berakhir dengan kemenangan 2-0 untuk Albicelestes. Ia juga dipanggil untuk bermain di Piala Dunia FIFA 2014 setelah cedera yang dialami oleh Ángel Di María.