Valera memulai karir profesionalnya di klub kota kelahirannya, Real Murcia, dan pertama kali tampil di La Liga pada musim 2003-2004, dengan bermain dalam sepuluh pertandingan selama musim tersebut. Pada musim 2005-2006, dia pindah ke Atlético Madrid, di mana kemajuannya terhambat oleh cedera. Pada 25 Februari 2006, dia mencetak dua gol sebagai pemain pengganti dalam kemenangan kandang 5-0 melawan Málaga CF.
Pada 1 September 2008, Valera setuju untuk dipinjamkan selama satu tahun ke Racing de Santander. Pada 5 Oktober, dia mencetak gol pertamanya untuk Racing de Santander dalam kemenangan kandang 1-0 di menit terakhir melawan CA Osasuna. Dia juga mencetak gol pada bulan Desember, tetapi hanya dalam kekalahan 3-1 di babak grup Piala UEFA melawan Manchester City.
Setelah dipanggil kembali untuk musim 2009-2010, Valera juga mengalami masalah fisik pada awalnya. Namun, dia berhasil tampil secara teratur untuk Atlético Madrid selama musim tersebut, dengan bermain lebih dari 30 pertandingan resmi, terutama sebagai bek kanan, bersaing dengan pemain internasional Luis Perea dan Tomáš Ujfaluši untuk posisi tersebut. Dia berkontribusi dengan tujuh pertandingan dalam perjalanan Atlético Madrid meraih kemenangan di Liga Europa, meskipun hanya tiga di antaranya sebagai starter, termasuk dalam kekalahan 1-2 melawan Liverpool di babak semifinal (agregat 2-2). Dia juga tampil selama satu menit di final.
Pada pertengahan Agustus 2011, setelah Valera dan Atlético Madrid sepakat untuk mengakhiri kontrak pemain yang berakhir pada bulan Juni tahun berikutnya, dia bergabung dengan Getafe CF, klub divisi teratas lainnya. Selama musim pertamanya, dia menjadi bek kanan pilihan utama, menggantikan Miguel Torres yang sudah lama menjadi bek kanan utama. Valera mencetak gol pertamanya pada tanggal 26 November 2011 saat mengalahkan FC Barcelona dengan skor 1-0 melalui sundulan pada menit ke-67 di Coliseum Alfonso Pérez.
Pada pertandingan kedua musim 2012-2013, Valera sekali lagi mencetak gol penyama untuk membantu Getafe meraih kemenangan kandang 2-1 melawan Real Madrid. Pada tanggal 3 Juni 2015, dia meninggalkan klub setelah kontraknya berakhir.
Valera meraih beberapa penghargaan selama karirnya, termasuk UEFA Europa League bersama Atlético Madrid pada musim 2009-2010 dan menjadi runner-up Copa del Rey pada musim yang sama. Dia juga memenangkan Mediterranean Games bersama tim U23 Spanyol pada tahun 2005.