Nagore lahir di Irurtzun, Navarre. Ia membuat debut di La Liga bersama Athletic Bilbao, bermain 17 pertandingan di musim 1997-1998 ketika klub tersebut menjadi runner-up liga. Ia pertama kali tampil di kompetisi tersebut pada 6 September 1997, bermain sebagai starter dalam pertandingan imbang 1-1 melawan Real Betis. Nagore kemudian bermain untuk CD Numancia, Atlético Madrid - mencatatkan 40 pertandingan terbaik dalam musim 2001-2002 ketika Atlético Madrid kembali ke kasta tertinggi sepak bola Spanyol, dan mencetak tiga gol - RCD Mallorca, RC Celta de Vigo, dan Levante UD, selalu menjadi pemain bertahan yang sering dimainkan meskipun jarang menjadi starter.
Pada musim panas 2006, Nagore kembali ke Numancia dan menjadi elemen kunci dalam kembalinya tim ke kasta tertinggi dalam tahun kedua Nagore di klub tersebut. Pada musim berikutnya, ia juga sering dimainkan, tetapi Numancia langsung terdegradasi. Pada 9 Mei 2013, Nagore tampil penuh 90 menit melawan Córdoba CF (kemenangan 1-0) untuk pertandingan ke-500-nya sebagai pemain profesional. Pada musim panas itu, setelah tampil dalam 235 pertandingan kompetitif lainnya untuk Numancia, Nagore yang berusia 39 tahun bergabung dengan klub Segunda División lainnya, yaitu CD Mirandés.
Adik laki-laki Nagore, Jorge (lahir 1971), bermain pelota Basque.
Prestasi yang diraih Nagore antara lain Segunda División bersama Atlético Madrid pada musim 2001-2002 dan bersama Numancia pada musim 2007-2008."