Pada tahun 2012, Yosua dipanggil untuk mengikuti seleksi timnas U-21 yang akan berlaga di Piala Hassanal Bolkiah 2012 di Brunei. Bersama dengan Andik, ia merupakan penyerang tercepat dalam tim tersebut. Kecepatannya terbukti saat Indonesia U-21 melawan klub asal Korea Selatan, Ulsan Hyundai Mipo Dockyard FC, di mana ia berhasil melewati bek lawan yang tinggi.
Di Piala Hassanal Bolkiah 2012, Yosua hanya mencetak satu gol saat melawan Filipina U-21, yang membuat kedudukan menjadi 3-0. Ia juga pernah dipanggil untuk menghadapi klub Eropa, Internazionale, pada tanggal 26 Mei 2012. Pada pertandingan tersebut, ia mencetak satu gol pada menit akhir babak kedua dan membuat kedudukan timnya menjadi 2-4.
Selain itu, Yosua juga telah mencetak gol internasional untuk timnas U-21 Indonesia. Informasi lebih lanjut tentang profil Yosua Pahabol dapat ditemukan di situs web Liga-Indonesia.co.id.