Stambouli memulai karir klubnya dengan Montpellier pada tahun 2004 setelah menghabiskan waktu singkat di Marseille dan Sedan. Dia membuat debut profesionalnya pada 8 Agustus 2010 dan menjadi bagian penting dalam kesuksesan Montpellier meraih gelar Ligue 1 pada musim 2011-2012. Selama musim 2013-2014, Stambouli bermain dalam 37 dari 38 pertandingan liga Montpellier dan naik pangkat menjadi wakil kapten tim.
Pada tahun 2014, Stambouli pindah ke Tottenham Hotspur dengan biaya yang tidak diungkapkan. Dia tampil dalam beberapa pertandingan Piala Liga bersama Tottenham, tetapi hanya membuat 12 penampilan di Liga Primer pada musim pertamanya. Pada tahun 2015, dia bergabung dengan Paris Saint-Germain dengan biaya £6 juta. Di PSG, Stambouli memenangkan empat trofi domestik dalam satu musim, tetapi tidak mencetak gol atau memberikan assist. Meskipun demikian, dia tidak populer di kalangan sebagian fans PSG karena hubungannya dengan rival mereka, Marseille.
Pada tahun 2016, Stambouli pindah ke Schalke 04 di Jerman dan menandatangani kontrak empat tahun. Dia membuat debutnya pada September 2016 dan menjadi pemain reguler dalam tim. Namun, pada Oktober 2019, dia mengalami cedera metatarsal yang mengakhiri musimnya. Pada Agustus 2020, dia memperpanjang kontraknya dengan Schalke hingga 2023. Namun, dia meninggalkan klub setelah mereka terdegradasi pada Mei 2021.
Pada Juli 2021, Stambouli bergabung dengan klub Turki, Adana Demirspor, dengan kontrak selama dua tahun. Dia segera menjadi pemain kunci dalam musim pertamanya, dengan mencetak 2 gol dan memberikan 4 assist dalam 32 pertandingan liga. Stambouli tetap konsisten dalam musim keduanya di klub tersebut.
Itulah sejumlah informasi mengenai Benjamin Stambouli, pemain sepak bola Prancis yang saat ini bermain sebagai gelandang bertahan atau bek tengah untuk klub Süper Lig, Adana Demirspor.