Selama kariernya, Jendri Pitoy juga telah mengikuti beberapa turnamen internasional yang mewakili tim nasional Indonesia. Pada tahun 2001, ia berpartisipasi dalam SEA Games di Kuala Lumpur, dan pada tahun 2003, ia juga bermain dalam SEA Games di Hanoi. Selain itu, Jendri Pitoy juga menjadi bagian dari tim nasional Indonesia yang berkompetisi dalam Piala Asia pada tahun 2004 dan Piala Asia pada tahun 2007. Di samping itu, ia juga ikut serta dalam Merdeka Games di Malaysia pada tahun 2006.
Jendri Pitoy juga memiliki beberapa prestasi yang patut diacungi jempol. Ketika bermain untuk Persipura Jayapura, ia berhasil meraih gelar juara Liga Indonesia pada tahun 2005. Selain itu, ia juga membantu timnya meraih gelar Liga Super Indonesia pada musim 2008-2009. Tidak hanya itu, Jendri Pitoy juga berhasil memenangkan Community Shield Indonesia pada tahun 2009 bersama Persipura Jayapura.
Di tingkat internasional, Jendri Pitoy juga telah mencapai beberapa pencapaian. Pada tahun 2002 dan 2004, ia menjadi bagian dari tim nasional Indonesia yang berhasil mencapai posisi runner-up dalam AFF Championship. Meskipun sudah tidak bermain lagi, Jendri Pitoy tetap diingat sebagai salah satu penjaga gawang terbaik Indonesia dengan kontribusinya yang luar biasa dalam dunia sepak bola Indonesia.