Derdiyok lahir di Basel, Swiss, dari keluarga Kurdi yang berasal dari Turki. Ia juga memiliki kewarganegaraan Turki.
Karier klub Derdiyok dimulai di klub sepak bola lokal Basel, BSC Old Boys Basel. Ia kemudian naik ke tim utama pada musim panas 2005 dan langsung menjadi pemain reguler. Di babak pertama musim tersebut, Derdiyok mencetak 10 gol dalam 18 penampilan. Pada babak kedua Swiss Cup 2005-2006, Old Boys Basel bertanding melawan FC Basel dan kalah 1-6, namun Derdiyok berhasil mencetak gol hiburan.
Kemampuan mencetak gol Derdiyok menarik perhatian pelatih FC Basel, Christian Gross, yang kemudian berhasil meyakinkannya untuk bergabung dengan klub tersebut pada musim 2006-2007. Derdiyok awalnya bermain untuk tim U-21 Basel yang bermain di divisi ketiga. Setelah mencetak 10 gol dalam 17 penampilan selama enam bulan, Derdiyok dipanggil oleh Gross untuk bergabung dengan tim utama Basel. Debut liga Derdiyok bersama Basel terjadi pada 11 Februari 2007, saat ia masuk sebagai pemain pengganti di menit ke-82 dalam kemenangan 3-0 atas Young Boys. Pada pertandingan berikutnya, Basel mengalahkan Old Boys dengan skor 6-1, dengan Derdiyok mencetak hat-trick dalam waktu kurang dari satu jam. Pada akhir musim Super League 2006-2007, Basel finis sebagai runner-up, hanya terpaut satu poin dari juara Zürich. Derdiyok lebih sering bermain sebagai pemain pengganti pada paruh kedua musim tersebut. Basel juga berhasil mencapai final Swiss Cup dan memenangkannya dengan skor 1-0 berkat gol penalti di menit ketiga tambahan waktu. Pada musim 2007-2008, Derdiyok mendapatkan lebih banyak waktu bermain dan tampil lebih konsisten. Basel juga tampil di UEFA Cup 2007-2008 dan berhasil mencapai babak 16 besar sebelum tereliminasi oleh Sporting CP. Derdiyok mencetak tujuh gol dalam 27 penampilan liga musim tersebut dan membantu Basel meraih gelar juara Liga dan Piala Swiss.
Pada awal musim 2008-2009, Derdiyok menjadi bagian dari tim Basel yang memenangkan Uhrencup. Basel mengalahkan Legia Warsaw 6-1 dan bermain imbang 2-2 dengan Borussia Dortmund untuk menjadi juara grup. Derdiyok terus tampil impresif dan menjadi salah satu penyerang utama Basel sebelum akhirnya berpindah ke klub lain dalam karier sepak bola profesionalnya.
Follow